Moses - Algorithmische Bioinformatik

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Modul / Version
#40323 / #1

Gültigkeit
SS 2014 - SS 2014

Verfügbare Sprache(n)
English

Titel des Moduls
Algorithmische Bioinformatik

Leistungspunkte
6

Modulverantwortliche*r
Niedermeier, Rolf

Benotung
Benotet

Prüfungsform
Mündliche Prüfung

Lehrsprache(n)
English

Zugehörigkeit

Fakultät
Fakultät IV

Institut
Institut für Softwaretechnik und Theoretische Informatik

Fachgebiet
34351100 FG Algorithmik und Komplexitätstheorie

Prüfungsausschuss
Keine Angabe

Kontakt

Sekretariat
TEL 5-1

Ansprechpartner*in
Thielcke, Christlinde

E-Mail-Adresse
lehre@akt.tu-berlin.de

Webseite

https://www.tu.berlin/en/akt/study-and-teaching/courses

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Diese Modulbeschreibung gilt nicht im aktuellen Semester.

Die Modulbeschreibung gilt nur für den Zeitraum SS 2014 - SS 2014.

Lernergebnisse

Participants of this module have knowledge of the formal modelling of computational tasks in biological data analysis. They are adept at devising efficient algorithms for these problems and at analysing their computational complexity. The course is principally designed to impart: technical skills 50%, method skills 50%, system skills 0% ,social skills 0%

Lehrinhalte

Topics include: • Construction of evolutionary trees • Suffix trees • Sequence comparison/alignment • Genome rearrangement • Haplotyping • Analysis of biological networks

Modulbestandteile

Compulsory area

Die folgenden Veranstaltungen sind für das Modul obligatorisch:

Lehrveranstaltungen	Art	Nummer	Turnus	Sprache	SWS	ISIS	VVZ
Algorithmic Bioinformatics	IV		WiSe/SoSe	Keine Angabe	4

ISIS-Kurssuche nach Veranstaltungen des Moduls

Arbeitsaufwand und Leistungspunkte

Algorithmic Bioinformatics (IV):

Aufwandbeschreibung	Multiplikator	Stunden	Gesamt
Presence in meetings	15.0	4.0h	60.0h
Privat study, including homework and exam preparation	15.0	8.0h	120.0h
			180.0h(~6 LP)

Der Aufwand des Moduls summiert sich zu 180.0 Stunden. Damit umfasst das Modul 6 Leistungspunkte.

Beschreibung der Lehr- und Lernformen

The course material is presented in lectures. The lectures are accompanied by tutorials in which an active participation and homework on the distributed work sheets is required.

Voraussetzungen für die Teilnahme / Prüfung

Wünschenswerte Voraussetzungen für die Teilnahme an den Lehrveranstaltungen:

a) obligatory: Basic knowledge of algorithm design and analysis

Verpflichtende Voraussetzungen für die Modulprüfungsanmeldung:

Dieses Modul hat keine Prüfungsvoraussetzungen.

Abschluss des Moduls

Benotung

Benotet

Prüfungsform

Oral exam

Sprache(n)

English

Dauer/Umfang

Keine Angabe

Prüfungsbeschreibung (Abschluss des Moduls)

Final oral exam determining the grade (MP). As a prerequisite, an active participation in the tutorials with presentation of own solutions of exercises is mandatory.

Dauer des Moduls

Für Belegung und Abschluss des Moduls ist folgende Semesteranzahl veranschlagt:
1 Semester.

Dieses Modul kann in folgenden Semestern begonnen werden:
Winter- und Sommersemester.

Maximale teilnehmende Personen

Dieses Modul ist nicht auf eine Anzahl Studierender begrenzt.

Anmeldeformalitäten

http://www.akt.tu-berlin.de/

Literaturhinweise, Skripte

Skript in Papierform

Verfügbarkeit: nicht verfügbar

Skript in elektronischer Form

Verfügbarkeit: verfügbar

Zusätzliche Informationen:

Literatur

Empfohlene Literatur
Böckenhauer & Bongartz: Algorithmic Aspec ts of Bioinformatics, Springer 2007
Dan Gusfield: Algorithms on Strings, Trees, and Sequences, Cambridge University Press 1997

Zugeordnete Studiengänge

Dieses Modul findet in keinem Studiengang Verwendung.

Studierende anderer Studiengänge können dieses Modul ohne Kapazitätsprüfung belegen.

Computer Science Master with focus “Reliable Systems” Computer Science Diploma Technical Computer Science Master with focus “Software Engineering” Technical Computer Science Diploma

Sonstiges

Keine Angabe