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#30154 / #7

WiSe 2021/22 - SoSe 2022

English

Modern Mass Spectrometry
Moderne Massenspektrometrie

6

Rappsilber, Juri

Benotet

Portfolioprüfung

English

Zugehörigkeit


Fakultät III

Institut für Biotechnologie

33311600 FG Bioanalytik

MSc Biotechnologie

Kontakt


TIB 4/4-3

Rullmann, Edward Vincent

juri.rappsilber@tu-berlin.de, e.rullmann@tu-berlin.de

Lernergebnisse

After finishing the course students will have gained knowledge about scientific softskills and applied mass spectrometry. The first part enables the student to read journal publications on their own, find the relevant information and present them in class. This will prepare the students for their master thesis / PhD and promote their critical assessment of papers. The second part enables students to get familiar with mass spectrometry based proteomics and the application in various (bio-medical) research questions.

Lehrinhalte

Softskills: In the soft skills area, students acquire knowledge in the areas of scientific writing, presentation, creation of illustrations and posters, how to read publications "correctly" and what scientific work involves in practice. In addition, important visualisation topics for the effective presentation of results are discussed. Modern mass spectrometry: In the mass spectrometry section, various in-depth articles from the field of mass spectrometry are available, e.g. phosphoproteomics, quantitative proteomics, SILAC, iTRAQ, peptide identification or cross-linking/mass spectrometry. In the seminars, real data are evaluated independently and under the guidance of an assistant. There will be tutorials for the most common software tools in MS-based proteomics (e.g. MaxQuant, KNIME, OpenMS, SearchGui). Translated with www.DeepL.com/Translator (free version)

Modulbestandteile

Compulsory area

Die folgenden Veranstaltungen sind für das Modul obligatorisch:

LehrveranstaltungenArtNummerTurnusSpracheSWS ISIS VVZ
Modern Mass Spectrometry for ProteinsSEMWiSeen2
Modern Mass Spectrometry for ProteinsVL 0335 L 681WiSeen2

Arbeitsaufwand und Leistungspunkte

Modern Mass Spectrometry for Proteins (SEM):

AufwandbeschreibungMultiplikatorStundenGesamt
Präsenzzeit15.02.0h30.0h
Vor-/Nachbereitung15.04.0h60.0h
90.0h(~3 LP)

Modern Mass Spectrometry for Proteins (VL):

AufwandbeschreibungMultiplikatorStundenGesamt
Präsenzzeit15.02.0h30.0h
Vor-/Nachbereitung15.04.0h60.0h
90.0h(~3 LP)
Der Aufwand des Moduls summiert sich zu 180.0 Stunden. Damit umfasst das Modul 6 Leistungspunkte.

Beschreibung der Lehr- und Lernformen

Introductory lectures are given by the lecturer; Additional lectures are based on the participation of students. The course builds upon a close contact and communication between students and lecturer. Individual appointments are mandatory to discuss the content and further questions regarding the student's presentation. The workflow is as follows: 1) preliminary discussion of the talk with the lecturer 2) giving the talk in the class and getting feedback 3) personal feedback of the lecturer

Voraussetzungen für die Teilnahme / Prüfung

Wünschenswerte Voraussetzungen für die Teilnahme an den Lehrveranstaltungen:

Knowledge from bioanalytics: - mass spectrometry - chromatography - peptides, proteins, lipids and other biomolecules Attending the course "Advanced Bioanalytics" is highly recommended.

Verpflichtende Voraussetzungen für die Modulprüfungsanmeldung:

Dieses Modul hat keine Prüfungsvoraussetzungen.

Abschluss des Moduls

Benotung

Benotet

Prüfungsform

Portfolio examination

Art der Portfolioprüfung

100 Punkte insgesamt

Sprache(n)

English

Prüfungselemente

NamePunkteKategorieDauer/Umfang
Participation15flexibelKeine Angabe
Mass Spectrometry Talk70mündlichKeine Angabe
Visualization Talk (Handout & Slides)15schriftlichKeine Angabe

Notenschlüssel

Notenschlüssel »Notenschlüssel 5: Fak III (1)«

Gesamtpunktzahl1.01.31.72.02.32.73.03.33.74.0
100.0pt95.0pt92.0pt89.0pt86.0pt83.0pt80.0pt77.0pt74.0pt71.0pt68.0pt

Prüfungsbeschreibung (Abschluss des Moduls)

Note on the Participation: Points can be earned for each lecture (approx. 15) by two simple requirements (max 1. point per lecture): 1) for *every* contribution (regardless of quality) a student makes during a lecture 0.5 points can be earned. 2) students need to be on time to earn the other 0.5 points per lecture.

Dauer des Moduls

Für Belegung und Abschluss des Moduls ist folgende Semesteranzahl veranschlagt:
1 Semester.

Dieses Modul kann in folgenden Semestern begonnen werden:
Wintersemester.

Maximale teilnehmende Personen

Die maximale Teilnehmerzahl beträgt 14.

Anmeldeformalitäten

Available slots are assigned by the central distribution system of the institute for biotechnology (information about the system are presented during the "Einführungsveranstaltung").

Literaturhinweise, Skripte

Skript in Papierform

Verfügbarkeit:  nicht verfügbar

 

Skript in elektronischer Form

Verfügbarkeit:  nicht verfügbar

 

Literatur

Empfohlene Literatur
Keine empfohlene Literatur angegeben

Zugeordnete Studiengänge


Diese Modulversion wird in folgenden Studiengängen verwendet:

Studiengang / StuPOStuPOsVerwendungenErste VerwendungLetzte Verwendung
Dieses Modul findet in keinem Studiengang Verwendung.

Sonstiges

Participants of the module are well prepared to write a master thesis in the field of bioanalytics in the proteomics area. The module can be included in List A as well as List B of the biotechnology course.