Moses - Computational Biology

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Modul / Version
#40377 / #6

Gültigkeit
WS 2017/18 - SS 2019

Verfügbare Sprache(n)
English

Titel des Moduls
Computational Biology

Leistungspunkte
6

Modulverantwortliche*r
Brock, Oliver

Benotung
Benotet

Prüfungsform
Portfolioprüfung

Lehrsprache(n)
English

Zugehörigkeit

Fakultät
Fakultät IV

Institut
Institut für Technische Informatik und Mikroelektronik

Fachgebiet
34341700 FG Robotik | Robotics and Biology Laboratory

Prüfungsausschuss
Keine Angabe

Kontakt

Sekretariat
MAR 5-1

Ansprechpartner*in
Stahl, Kolja

E-Mail-Adresse
lehre@robotics.tu-berlin.de

Webseite

http://www.robotics.tu-berlin.de/menue/teaching/

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Die Modulbeschreibung gilt nur für den Zeitraum WS 2017/18 - SS 2019.

Lernergebnisse

The module conveys the necessary background knowledge in molecular and cell biology for students to conduct research in the area of computational structural biology. Special emphasis is given to topics in the intersection of computer science and molecular biology. The course introduces relevant algorithms and concepts from computational biology, computer science, robotics, optimization, etc.

Lehrinhalte

Search and optimization, molecular biology, DNA, RNA, protein structure prediction, dynamic programming, cellular biology, statistics, probabilistic models, bioinformatics, genomics, proteomics, protein folding, protein motion, protein docking, protein design, robotics motion planning.

Modulbestandteile

Compulsory area

Die folgenden Veranstaltungen sind für das Modul obligatorisch:

Lehrveranstaltungen	Art	Nummer	Turnus	Sprache	SWS	ISIS	VVZ
Computational Biology	VL	0433 L 410	WiSe	Keine Angabe	2
Computational Biology	UE	0433 L 411	WiSe	Keine Angabe	2

ISIS-Kurssuche nach Veranstaltungen des Moduls

Arbeitsaufwand und Leistungspunkte

Computational Biology (VL):

Aufwandbeschreibung	Multiplikator	Stunden	Gesamt
Preparation and review	15.0	2.0h	30.0h
Presence in lectures	15.0	2.0h	30.0h
			60.0h(~2 LP)

Computational Biology (UE):

Aufwandbeschreibung	Multiplikator	Stunden	Gesamt
Assignments	15.0	4.0h	60.0h
Presence in exercises	15.0	2.0h	30.0h
			90.0h(~3 LP)

Lehrveranstaltungsunabhängiger Aufwand:

Aufwandbeschreibung	Multiplikator	Stunden	Gesamt
Exam preparation	1.0	30.0h	30.0h
			30.0h(~1 LP)

Der Aufwand des Moduls summiert sich zu 180.0 Stunden. Damit umfasst das Modul 6 Leistungspunkte.

Beschreibung der Lehr- und Lernformen

The course consists of lectures and applied programming exercises.

Voraussetzungen für die Teilnahme / Prüfung

Wünschenswerte Voraussetzungen für die Teilnahme an den Lehrveranstaltungen:

No prior knowledge of biology is needed. Python or C++ knowledge is required! Bachelor degree in relevant field of study; Bachelor students in 7th semester of "Technische Informatik" can register after consultation with the professor.

Verpflichtende Voraussetzungen für die Modulprüfungsanmeldung:

Dieses Modul hat keine Prüfungsvoraussetzungen.

Abschluss des Moduls

Benotung

Benotet

Prüfungsform

Portfolio examination

Art der Portfolioprüfung

100 Punkte insgesamt

Sprache(n)

English

Prüfungselemente

Name	Punkte	Kategorie	Dauer/Umfang
(Deliverable assessment) 5 Assignments	50	praktisch	1-5 pages of text and code per assignment
(Examination) Written Exam	50	schriftlich	75

Notenschlüssel

Notenschlüssel »Notenschlüssel 2: Fak IV (2)«

Gesamtpunktzahl	1.0	1.3	1.7	2.0	2.3	2.7	3.0	3.3	3.7	4.0
100.0pt	95.0pt	90.0pt	85.0pt	80.0pt	75.0pt	70.0pt	65.0pt	60.0pt	55.0pt	50.0pt

Dauer des Moduls

Für Belegung und Abschluss des Moduls ist folgende Semesteranzahl veranschlagt:
1 Semester.

Dieses Modul kann in folgenden Semestern begonnen werden:
Wintersemester.

Maximale teilnehmende Personen

Die maximale Teilnehmerzahl beträgt 40.

Anmeldeformalitäten

See http://www.robotics.tu-berlin.de/menue/teaching/ Registration for the exam in compliance with the regulations; further information is provided in the lecture.

Literaturhinweise, Skripte

Skript in Papierform

Verfügbarkeit: nicht verfügbar

Skript in elektronischer Form

Verfügbarkeit: nicht verfügbar

Literatur

Empfohlene Literatur
Amit Kessel, Nir Ben-Tal. Introduction to Proteins: Structure, Function, and Motion, 2011.
Market Zvelebil, Jeremy O. Baum. Understanding Bioinformatics. Taylor & Francis Ltd., 2008.
Tamar Schlick. Molecular Modeling and Simulation: An Interdisciplinary Guide Springer, 2010.

Zugeordnete Studiengänge

Semester:

Zeige auch ausgelaufene Studiengänge und StuPOs

Diese Modulversion wird in folgenden Studiengängen verwendet:

	Studiengang / StuPO	StuPOs	Verwendungen	Erste Verwendung	Letzte Verwendung
Dieses Modul findet in keinem Studiengang Verwendung.

Master students in Computer Science StO/PO 2010/ Focus Intelligent Systems Master students in Computer Science StO/PO 2016 / Focus Cognitive Systems Master students in Computer Engineering / Focus Information Systems Master students in Computer Engineering StO/PO 2014: Focus Cognitive Systems and Robotics, Computer Science Focus Information Systems, Computer Science

Sonstiges

Keine Angabe