Moses - Bioinformatics in Applied Microbiology

Anzeigesprache

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Modul / Version:
#30058 / #5

Gültigkeit:
Seit WS 2018/19

Standard-Anzeigesprache:
Deutsch

Titel des Moduls:
Bioinformatics in Applied Microbiology
Bioinformatik in der Angewandten Mikrobiologie

Leistungspunkte:
6

Modulverantwortliche*r:
Meyer, Vera

Benotung:
benotet

Prüfungsform:
Portfolioprüfung

Zugehörigkeit

Fakultät:
Fakultät III

Institut:
Institut für Biotechnologie

Fachgebiet:
33311400 FG Angewandte und Molekulare Mikrobiologie

Prüfungsausschuss:
MSc Biotechnologie

Kontakt

Sekretariat:
TIB 4/4-1

Ansprechpartner*in:
Regner, Carmen

E-Mail-Adresse:
regner@tu-berlin.de

Webseite:
Keine Angabe

Lernergebnisse

Die Studierenden sollen: • ihre bisher erworbenen molekulargenetischen Kenntnisse um die Themenschwerpunkte Systembiologie, synthetische Biologie und „Omics“ Technologien erweitern, • aktuelle Methoden und Strategien der modernen Datenauswertung in der Mikrobiologie kennen und verstehen lernen, • lernen, das erworbene Wissen auf der Grundlage rechnerbasierter Methoden anzuwenden. • dazu befähigt werden, systembiologische Prozesse eigenständig auszuwerten. Die Veranstaltung vermittelt: 40% Anwendung & Praxis; 30% Wissen & Verstehen; 10% Analytik & Methodik; 10% Recherche & Bewertung; 10% Sozialkompetenz

Lehrinhalte

Grundlegende Konzepte der informationstechnischen Datenauswertung. Nutzung von Open Source Programmen, Datenbanken und Plattformen zur Transkriptom- und Genomanalyse: Scriptsprachen und automatisierte Pipelines, „Enrichment“ Analysen, Gennetzwerkerstellung und -Auswertung. Als Modellsystem wird Aspergillus niger genutzt.

Modulbestandteile

Pflichtteil:

Die folgenden Veranstaltungen sind für das Modul obligatorisch:

Lehrveranstaltungen	Art	Nummer	Turnus	Sprache	SWS	VZ
Bioinformatics in Applied Microbiology	PR	0335 L 056	WiSe/SoSe	Deutsch	4

Arbeitsaufwand und Leistungspunkte

Bioinformatics in Applied Microbiology (PR):

Aufwandbeschreibung	Multiplikator	Stunden	Gesamt
Präsenzzeit	15.0	4.0h	60.0h
Prüfungsvorbereitung	15.0	4.0h	60.0h
Vor-/Nachbereitung	15.0	4.0h	60.0h
			180.0h(~6 LP)

Der Aufwand des Moduls summiert sich zu 180.0 Stunden. Damit umfasst das Modul 6 Leistungspunkte.

Beschreibung der Lehr- und Lernformen

In diesem Programmierpraktikum werden anhand spezifischer Fragestellungen systembiologisches Wissen angewandt und vertieft, sowie neues Wissen im Bereich der Auswertung von Genom- und Transkriptomdaten mit Methoden der Informationstechnik erworben und gefestigt. Das Verstehen wird durch Übungsaufgaben gefördert. Die hierbei entwickelten (alternativen) Lösungswege und Ergebnisse werden im Rahmen von Kurzvorträgen vorgestellt und mit allen Teilnehmern diskutiert.

Voraussetzungen für die Teilnahme / Prüfung

Wünschenswerte Voraussetzungen für die Teilnahme an den Lehrveranstaltungen:

Bachelor Biotechnologie oder verwandte Fachrichtungen, gute Kenntnisse der Molekulargenetik sowie der englischen Sprache. Ein generelles Interesse an systembiologischen Fragestellungen und Konzepten der Bioinformatik sollte vorhanden sein.

Verpflichtende Voraussetzungen für die Modulprüfungsanmeldung:

Dieses Modul hat keine Prüfungsvoraussetzungen.

Abschluss des Moduls

Benotung

benotet

Prüfungsform

Portfolioprüfung

Art der Portfolioprüfung

100 Punkte insgesamt

Sprache

Deutsch/Englisch

Prüfungselemente

Name	Punkte	Kategorie	Dauer/Umfang
Abschlusspräsentation	40	mündlich	15 min
Eigenständige Problemlösungen	20	praktisch	praktikumsbegleitend
Ergebnissicherung	40	schriftlich	praktikumsbegleitend

Notenschlüssel

Notenschlüssel »Notenschlüssel 6: Fak III (2)«

Gesamtpunktzahl	1.0	1.3	1.7	2.0	2.3	2.7	3.0	3.3	3.7	4.0
100.0pt	90.0pt	85.0pt	80.0pt	75.0pt	70.0pt	66.0pt	62.0pt	58.0pt	54.0pt	50.0pt

Prüfungsbeschreibung (Abschluss des Moduls)

Portfolioprüfung: Details siehe oben. Benotung gemäß Notenschlüssel Fak III (Schema 2). Die beiden Lehrveranstaltungen gehen zu gleichen Teilen in die Benotung ein.

Dauer des Moduls

Für Belegung und Abschluss des Moduls ist folgende Semesteranzahl veranschlagt:
1 Semester.

Dieses Modul kann in folgenden Semestern begonnen werden:
Winter- und Sommersemester.

Maximale teilnehmende Personen

Die maximale Teilnehmerzahl beträgt 16.

Anmeldeformalitäten

Die Anmeldung zum Modul erfolgt online. Details werden zu Beginn des Semesters bekannt gegeben.

Literaturhinweise, Skripte

Skript in Papierform

Verfügbarkeit: nicht verfügbar

Skript in elektronischer Form

Verfügbarkeit: verfügbar

Zusätzliche Informationen:
Den Teilnehmer(innen) wird ein Handout auf der ISIS-Homepage zur Verfügung gestellt.

Literatur

Empfohlene Literatur
Keine empfohlene Literatur angegeben

Zugeordnete Studiengänge

Semester:

Zeige auch ausgelaufene Studiengänge und StuPOs

Diese Modulversion wird in folgenden Studiengängen verwendet:

	Studiengang / StuPO	StuPOs	Verwendungen	Erste Verwendung	Letzte Verwendung
	Biologische Chemie (M. Sc.)	1	3	SoSe 2023	SoSe 2024
	Biotechnologie (M. Sc.)	1	24	WS 2018/19	SoSe 2024

Wahlpflichtmodul für den Masterstudiengang Biotechnologie Wahlpflichtmodul für den Masterstudiengang Biologische Chemie

Sonstiges

Keine Angabe